超级计算机模拟可以显示我们如何停止covid

2020年8月13日

重要工作检查冠状病毒如何侵入我们的细胞也可以解锁潜在的药物治疗。

在打击covid-19的战斗,你需要在你的军械库多种武器成为可能。如果你有澳大利亚和南半球最强大的和最快的超级计算机不会受到伤害。

这就是澳门赌场研究员 副教授梅根·奥马拉 。委托在2019年后期, 这就是澳门赌场研究员 超级计算机是在一个名为 是由资助 如此强大的是 排名24 加迪, NCI 加迪 有在她的指尖。她使用 加迪,安置在对澳门赌场校园,帮助国家计算基础设施(NCI澳大利亚)了解冠状病毒侵入人体细胞。

如此强大的是 加迪, 它有 被评为美国精英主导covid-19高性能计算财团的成员。它也允许副教授奥马拉和她的团队成员,医生凯蒂·威尔逊博士和斯蒂芬患难与共,对我们身体的重要受体,该冠状病毒被利用来攻击我们的细胞运行80万个原子模拟。

使用运行超过19天,从分子水平来完成64个模拟48个处理器,她的研究将花费约为1300万小时,未来几个月的计算时间。相比之下,同样的工作需要人在1500年一个单一的计算机做常数计算。如果fortnite更是你的事,有什么 加迪 将在不到三个星期做等于2650年高端游戏机上不停的使用。

教授欧马将使用来自计算机模拟结果,了解由病毒感染的第一步。她说,这一重要工作,不仅有利于我们了解该病毒是如何侵入我们的细胞,但可能会导致靶向药物设计来阻止它。

“这是只有准确地复制这些受体的真实行为,我们可以计算出在哪里病毒的结合过程中的安全漏洞,高分辨率建模”副教授奥马拉说。

“针对人类受体和冠状病毒结合蛋白之间的相互作用很可能是药物设计的有用的方向。这个项目将产生约受体可能是潜在的疫苗或药物作用靶点的地区世界第一的重要信息。

“我们将用电脑屏幕药物与受体结合复杂的,因此可以防止发生变化必需的病毒结合。我们的目标是确定药物,可以从感染人体细胞停止病毒。

“从这个NCI的分配是我们的研究是绝对必要:受体复合物是如此庞大而复杂的是新华保险的新 加迪 超级计算机是南半球足够强大的做这些模拟的超级计算机只“。

NCI的 加迪 超级计算机是在一个名为 当地ngunnawal语言,意思是“搜索”。委托在2019年后期, 加迪 排名24 在2020年6月500强 - 一居全世界最快的超级计算机。 加迪 是由资助 澳大利亚政府$70米投资.

一夜之间,科学和技术的白宫办公室命名 加迪 和CSIRO的pawsey超级计算机中心 雨云 作为成员美国为首的covid-19高性能计算财团。作为“澳大利亚HPC covid-19快速反应(NCI澳大利亚和pawsey超级计算机中心)”,这两个超级计算机将提供给来自世界各地的研究人员谁是从多个角度黏合covid-19。

美国财团是由白宫办公室科技政策,美国能源部门和IBM牵头召集联邦政府,行业独特的公私努力,谁是志愿者在免费的计算时间和资源,学科带头人他们世界级的机器。